《办法》规定，紫阳县河长制实行属地管理、辖区负责的工作机制。各级党委、政府主要负责人是河长制的第一责任人，承担河长制工作的领导责任；各级河长为直接责任人，按照工作分工对河长制负主管责任；县直各相关部门按照各自工作职责承担河长制工作的相应责任。
《办法》强化问责追责，同时细化了13种问责情况，对未按照河长制要求，责任主体及任务分解不明晰；未完成县河长制年度考核内容或阶段性任务的；未及时发现水环境违法违规问题，或发现问题后不及时制止和报告，造成不良后果的；未积极主动协调河道问题整改，经上级督办、通报仍无实质性进展的；对社会反映强烈的水环境问题处置失当等情形列入问责范围。
同时，《方法》要求，对拒绝改正错误，干扰、阻碍问责工作的；存在弄虚作假，瞒报、虚报事实真相的；对投诉人、控告人、检举人打击报复等情形，将严肃查处，从重处理，切实做到失责必问、问责必严。
