《方案》首次提出建立水环境横向补偿机制，按照“保护者收益、使用者补偿、污染者受罚”的原则，科学界定生态环境保护者的权利和责任，建立合理的生态保护补偿标准、考核评价制度和沟通协调的运行机制，充分发挥政府对生态环境保护的主导作用，加强市县（区）统筹，保障南川河流域生态保护主体的相关权益。
《方案》开创性地提出水库水量补偿制度，并通过与流域监测断面水质补偿有机融合，构建起以县区级横向补偿为主的水量、水质一体式生态补偿机制。
日前，青海西宁市印发了首个生态补偿方案——《西宁市南川河流域水环境生态补偿方案》，对保证生态建设的可持续性，实现区域生态环境共建共享，实现西宁市绿色发展样板城市建设，推动低碳循环绿色发展具有重要意义。
