化肥过量是土壤污染的一个重要因素，过量使用化肥可导致土壤板结、酸化加剧、盐碱化致使肥料利用率极低，地下水遭受污染，作物长势差，品质下降，效益低等连锁反应。我国化肥的利用率不高，当季氮肥利用率仅为35%，而温室大棚内更低只有10%。解决化肥利用率低下的问题，水肥一体化势在必行。
相比传统的大水漫灌，水肥一体化可以节水30%以上，省肥30%-50%，人工成本降低70%左右，水和肥料利用率可达90%以上，大面积推广应用，将获得可观的经济效益和社会效益。
与传统灌溉施肥措施相比：水肥一体化技术能够提高水肥利用率，保证水分、养分均衡供应每棵作物，从而省水省肥，降低农药用量，使农产品更加安全。以葡萄为例，采用水肥一体化后需水5-10m?/亩，比传统漫灌节水30%-40%;
葡萄通过开沟回填方式常年需使用复合肥100kg/亩，钾肥20kg/亩，二铵30kg/亩，而采用水肥一体化管理方式后仅使用液体肥55kg/亩。惠生园生态农场常规浇水施肥需要8个工人6天干完，运用水肥一体化技术后，每次浇水施肥仅1个工人2天干完，比常规节省人工90%以上。
应用水肥一体化，肥料的选择很有讲究。可选液态或固态肥料，如氨水、尿素、硫铵、硝铵、磷酸一铵、磷酸二铵、氯化钾、硫酸钾、硝酸钾、硝酸钙、硫酸镁等肥料;固态以粉状或小块状为首选，要求水溶性强，含杂质少，一般不应该用颗粒状复合肥(包括中外产品);如果用沼液或腐殖酸液肥，必须经过过漏，以免堵塞管道。
