深圳河是深圳与香港的界河，发源于牛尾岭南坡，自东北向西南流入深圳湾，全长37公里。曾经在城市高速发展过程中，由于污水收集处理设施的不完善，深圳河除了承担防洪功能外，也接纳了大量的生活、生产污废水，导致河流黑臭。
经过近几年集中攻坚治理，2019年深圳河水质实现突破性改善，主要污染指标氨氮和总磷超标率持续降低。全年均值达地表水Ⅴ类标准，旱季达到IV类，为自1982年有监测数据以来的最好水平。深圳河（湾）吸引了大批珍稀鸟类以及白海豚回归栖息，成为“海上看深圳”的亮丽风景线。
系统治理，率先探索暗涵化河道治理方案
为治理深圳河流域的黑臭污染，深圳持续、系统地开展流域内污染治理工作，专门成立市水污染治理指挥部，对全市治水工作进行统筹指导，并抽调全市技术力量成立深圳河湾流域下沉督办协调组，在流域内开展综合协调、技术指导、督查督办工作。
近年来，系统实施污水收集管网建设、雨污分流、小区内污染源正本清源、干支流及暗涵综合整治、污水处理厂提标改造扩建等措施，有效削减了进入深圳河的污染源。
据悉，自2016年以来，深圳河流域共实施80余项治水骨干工程，新增污水管网409公里，完成2044个正本清源小区建设，河湾流域污水处理能力达到228.6万吨/天，出水水质基本可达到准IV类。这些措施有效削减了进入深圳河的污染源，水质净化厂的高标准出水为河道提供了源源不断的生态补水。
同时，率先在全市探索暗涵化河道治理方案，通过实施暗渠清淤、截污，打开暗渠总口，从根本上解决河流污染顽疾。2019年加速推进了福田河、新洲河、皇岗河、笔架山河、清水河等10余条暗涵化河道的清淤和截污纳管工程，整治暗涵总长达53.6公里，清淤总量为13.47万方，新建截污管48.7公里。
开拓创新，打造流域一体化治水新模式
深圳河流域（深圳境内）共有深圳河干流，以及莲塘河、沙湾河（深圳水库排洪河）、布吉河、福田河和皇岗河这5条支流，最终通过深圳河口进入深圳湾。其干支流、左右岸、上下游之间的水量和水质之间彼此影响，支流差则干流差，干流差则河口差。
长期以来，由于深圳河流域内共有多家排水运营单位，存在运营管理主体不一、流域治理碎片化问题。为改变过去“分头治理、头痛医头、脚痛医脚”模式，深圳最终决定以流域作为完整的系统单元，创新实施“厂网河一体化”全要素治理模式。
“厂网河一体化”全要素治理模式，通过构建流域一张信息网络，打造流域一个管理平台，将流域内分散的各要素串联起来，充分发挥流域内排水设施的整体能力，提高流域污水收集、输送与处理保障水平，最大限度消减污染负荷。
在进一步优化管理，推行“厂网河”全要素调度的同时，扎实推进“排水管理进小区”， 解决排水管理“最后一公里”问题；持续开展清“三池”（化粪池、隔油池、垃圾池）、治“三产”（餐饮、汽修、农贸市场）工作；下沉督导，包河到人，每天巡河，确保污水不入河。
成效显著，流域内主要河流水质明显改善
随着一系列工程措施的实施，以及深圳河流域实现全要素治理，近年来深圳河水质呈现持续好转趋势。根据市生态环境局提供的水质监测数据，位于深圳河口的国家考核控制断面水质已于2018年底达到并优于地表水V类标准。在2018年底达到V类水的基础上，2019年再上新台阶。
2019年1-12 月主要水质指标溶解氧、氨氮、总磷浓度分别为3.45mg/L、1.57mg/L、0.23mg/L，同比分别改善 29.2%、59.5%、25.1%，为自1982年有监测数据以来的最好水平。
流域内主要河流水质取得显著成效。目前，深圳河流域内18个黑臭水体、345个小微黑臭已全部实现消除黑臭，主要河流水质明显改善。
下一步，市水务部门将按照省委省政府开展万里碧道建设的总体部署，统筹谋划治水、治产、治城，优化生态、生产、生活空间格局，高标准地规划深圳河北岸碧道，提升城市环境品质，营造“水清岸绿、鱼翔浅底、水草丰美、白鹭成群”的生态廊道，将深圳河北岸建设为“城市的蓝脉，都市的阳台”。
