农村地区的中小河流河道治理是加强生态环境保护,促进农村生态环境健康发展从而进一步推进美丽城镇建设的关键举措，但随着近年来社会经济的快速发展，农民生活水平提高的同时，农村河道也遭到了严重的破坏，水污染问题日益严重。
一、工业废水污染
与河道相通的化工厂产生的污水不经过任何处理或处理不达标就排放到河流中，使河道生态系统处于亚健康状态。
二、农村生活垃圾污染
大多农村没有广泛建立垃圾处理系统，一些腐烂的菜叶、瓜果皮、塑料袋、废旧电池等不能及时回收和有效处理，产生的大量酸性和碱性有机污染物及重金属造成地表水和地下水的严重污染。
三、农业污染
化肥、农药等污染物通过农田排水及地表径流等方式进入地表水体，引起地表水体的富营养化，与此同时，又渗入到地下水中，严重影响了地表水和地下水的水质。
四、畜牧养殖业污染
农村畜牧养殖业产生的养殖废水直接排到河道中以及中小型养殖场由于未配置配套处理设施而导致的废水排放。
加强农村河流治理与保护工作是实施“河长制”不可或缺的重要环节，在发挥河长的领导作用，严格考核制度，充分调动农民积极性的同时，也要积极实施环境保护教育，双管齐下，最终实现农村河流河畅、水清、岸绿、景美的目标。
