2014年，福建省启动排污权试点，在造纸、水泥、皮革、合成革与人造革、建筑陶瓷、火电、合成氨、平板玻璃等8个行业试点推行。2017年，在全省工业排污单位全面推行，开发排污权金融属性，建立排污权储备体系。截至2017年年底，该省共举行了67场排污权交易，累计1440家企业参与，总成交金额7.97亿元，排污权有偿使用收入总计4.46亿元。
该省还建立碳交易市场，将10个行业年能源消费总量1万吨标准煤以上（含）的277家企业纳入碳交易。截至2017年年底，累计成交量428.28万吨，总成交金额1.13亿元。
同时，福建省培育发展农村污水垃圾处理和农业面源污染治理市场主体，采取政府资金引导、税收政策优惠、加大绿色金融创新支持等方式吸引社会资本，鼓励其以PPP工程包或购买服务的模式参与农村污水垃圾处理、农业面源污染治理，形成政府、企业、社会三方共治格局。2017年在全国率先出台了鼓励社会资本投资村镇污水处理设施、生活垃圾处理等领域PPP工程包的实施方案。通过集中打包加大投资规模，吸引社会力量投资和运营，采用“一包一策”方式给予用地、专项资金补助、提供融资增信等政策支持。推进环境污染责任保险，截至2017年11月底，全省投保环责险企业共396家，责任限额5.9亿元。
在建立农村污水垃圾治理长效机制方面，2017年起，省级财政安排补助资金1亿元，按村庄常住人口每年每人补助10元；安排补助资金对已建成并正常运行的微动力乡镇污水处理设施，按照设施运行电费补助1/3。2017—2020年，对采用厂网一体化运营的乡镇及农村生活污水处理PPP工程包项目，根据项目达标的污水处理量给予运营专项补助上浮20%，财政资金从补建设向补运营转变。
