根据协议，两省市以位于重庆市秀山县与湖南省湘西州花垣县交界处的国家考核断面里耶镇的水质为依据，实施酉水流域横向生态保护补偿。断面水质评价直接采用国家公布的水质监测数据，根据国家确定的里耶断面水质评价结果按月核算酉水流域横向生态保护补偿资金，达标由湖南补偿重庆，超标由重庆补偿湖南。协议有效期为2019年1月1日至2021年12月31日。
协议还规定，湘渝两省市将建立完善协调沟通、信息共享、监测预警、应急响应、执法协作、合力治污等联防共治机制，共同加强酉水流域锰污染防控，保护酉水流域水环境。
