在线和离线脉冲布袋除尘器的区别在于其结构形式不同。离线式脉冲布袋除尘器本体分隔成数个室区，每室有32、64、96、128等条袋子。每室侧边出口管道上有一个气缸带动的提气阀。当除尘器过滤含尘气体时间后（或阻力达到预先设定值），清灰控制器就发出信号。个室的提气阀就开始关闭以切断过滤气流。然后这个室的脉冲阀开启，滤袋上的粉尘。当这个动作完成后（大约3-7s时间），提升阀重新打开，使这个室重新进行过滤工作，并逐按上述要求进行以至全部清灰完毕。各除尘室的脉冲喷吹宽度和清灰周期，由清灰程序控制器自动连续进行，从而保证了压缩空气清灰的效果。
在线式脉冲布袋除尘器本体不分隔成数个室区，整个箱体就是一个室，没有提气阀，清灰是在除尘器过滤烟气的时进行的，但脉冲的顺序是通过程序控制的。此种形式除尘器操作简单，用于处理烟气量不大的情况。这两种除尘器整个箱体设计利用了和出口总管结构，灰斗可延伸到总管下。使进入的含尘烟气直接进入已扩大的灰斗内达到预除尘的效果，且能去掉易出现堵塞的水平直管，但由于离线式脉冲布袋除尘器是分室清灰，压缩空气清灰压力高，在线式脉冲布袋除尘器为一整体箱室，相对压缩空气清灰压力低，因此收尘效率不如离线式脉冲布袋除尘器高。
