据了解，云南省生态保护红线基本格局呈“三屏两带”。“三屏”：青藏高原南缘滇西北高山峡谷生态屏障、哀牢山—无量山山地生态屏障、南部边境热带森林生态屏障。“两带”：金沙江、澜沧江、红河干热河谷地带，东南部喀斯特地带。
主要类型和分布范围包含生物多样性维护、水源涵养、水土保持三大红线类型，11个分区。11个分区具体为：滇西北高山峡谷生物多样性维护与水源涵养生态保护红线；哀牢山—无量山山地生物多样性维护与水土保持生态保护红线；南部边境热带森林生物多样性维护生态保护红线；大盈江—瑞丽江水源涵养生态保护红线；怒江下游水土保持生态保护红线；澜沧江中山峡谷水土保持生态保护红线；红河（元江）干热河谷及山原水土保持生态保护红线。
此外，涉及昆明区域的有高原湖泊及牛栏江上游水源涵养生态保护红线。该区域涉及昆明、玉溪、红河、大理、丽江5个州市，面积0.57万平方千米，占全省生态保护红线面积的4.81%，是我省构造湖泊和岩溶湖泊分布最集中的区域。重点保护物种有白腹锦鸡、云南闭壳龟、滇池金线鲃等珍稀动植物。已建有金殿国家森林公园、云南苍山洱海国家级自然保护区等保护地。
珠江上游及滇东南喀斯特地带水土保持生态保护红线。该区域涉及昆明、曲靖、玉溪、红河、文山5个州市，面积1.45万平方千米，占全省生态保护红线面积的12.25%。重点保护物种有灰叶猴、蜂猴、金钱豹、黑鸢、云南穗花杉、毛枝五针松、钟萼木等珍稀动植物。已建有云南文山国家级自然保护区、石林世界自然遗产地等保护地。
金沙江干热河谷及山原水土保持生态保护红线。该区域位于滇川交界的金沙江河谷地带，涉及昆明、楚雄、大理、丽江4个州市，面积0.87万平方千米，占全省生态保护红线面积的7.35%。重点保护物种有林麝、中华鬣羚、穿山甲、黑翅鸢、云南红豆杉等珍稀动植物。已建有云南轿子雪山国家级自然保护区、楚雄紫溪山省级自然保护区等保护地。
金沙江下游—小江流域水土流失控制生态保护红线。该区域位于我省东北部，涉及昆明、曲靖、昭通3个市，面积0.73万平方千米，占全省生态保护红线面积的6.17%，是高原边缘的中山峡谷区，重点保护物种有金钱豹、云豹、小熊猫、南方红豆杉等珍稀动植物。已建有云南大山包黑颈鹤国家级自然保护区、云南乌蒙山国家级自然保护区等保护地。
