相较于“老版条例”，修改后的《合肥市大气污染防治条例》（以下简称“新版条例”）提高了对环境违法行为的处罚标准。比如，向大气排放污染物超过规定排放标准的，由市、县（市）区人民政府环境保护行政主管部门责令停止排污或者限制生产、停业整治，将“10000元以上50000元以下罚款”提升为“二十万元以上一百万元以下罚款”；情节严重的，报经有批准权的人民政府批准，责令停业、关闭。
此前，在禁燃区内燃用高污染燃料的，只是“由环境保护行政主管部门责令拆除或者没收燃用高污染燃料的设施”。而“新版条例”规定，除了拆除燃用高污染燃料的设施外，还将处以五万元以上二十万元以下罚款。
此外，在人口集中地区和其他依法需要特殊保护的区域内，从事橡胶制品生产、经营性喷漆、制骨粉、屠宰、畜禽养殖、生物发酵等产生恶臭、有毒有害气体和粉尘的生产经营活动，以及露天焚烧油毡、沥青、橡胶、塑料、皮革、垃圾或者其他产生有毒有害烟尘和恶臭气体等物质的，“老版条例”只是笼统地规定：“责令停止违法行为，限期改正，给予警告，或者处以2000元以上10000元以下罚款”，而“新版条例”则是将责任划分为企事业单位和个人，并分别规定了罚款数额，“由市、县（市）区人民政府确定的监督管理部门责令改正，对企事业单位处以二万元以上十万元以下罚款，对个人处以五百元以上二千元以下罚款”。
对施工工地的扬尘污染，“新版条例”对此做出新规定，建设单位应当在施工前向市、县（市）区人民政府工程建设有关部门提交施工工地扬尘污染防治方案，保障施工单位扬尘污染防治专项费用，并在施工承包合同中明确施工单位扬尘污染防治责任。扬尘污染防治专项费用应当列入安全文明施工措施费，作为不可竞争费用纳入工程建设成本。
对拆迁工地应采取湿法作业。渣土及建筑垃圾车辆密闭运输，按照管理部门规定的时间、路线和要求，清运到指定的场所处理。启动Ⅲ级（黄色）预警或气象预报风速达到四级以上时，不得进行土方挖填、转运和拆除等易产生扬尘的作业。
