在还未清理的河道上，记者看到了被丢弃的共享单车、塑料椅子、饮料瓶、塑料袋、蜂窝煤等各类垃圾。有些长期浸染在河底的早已褪色或发黑发绿，有些则明显可以看出是刚被扔下不久。在清淤过程中，这些大大小小的垃圾全都要靠人工打捞上岸。
2008年1月1日起实施的《泉州市市区内沟河保护管理条例》明确规定：“倾倒渣土、垃圾、泥浆或其他废弃物的，由市、区内沟河行政主管部门依法责令停止违法行为，限期改正，处二万元以上五万元以下的罚款。”但在居民生活区密集的渠段，仍然可见大量生活垃圾被随意丢弃在河渠中。其中，塑料袋等“软垃圾”经常会缠绕在抽泥机的螺旋叶片上，工人们不得不徒手清理干净，以保证机器正常工作，这也在一定程度上影响了清淤的速度。
顺着渠道里一根深蓝色的软管，整个东干渠渠底的淤泥将被输送到淤泥固化站，进行无害化处理。在淤泥固化站里，一块块制作好的泥饼已基本没有异味。从空中掉落砸碎后，经由铲土车统一转移到指定地点堆放，最终将被送往垃圾填埋场进行填埋。据了解，整个东干渠的清淤工作将力争于10月30日前全面完成。
