“十三五”以来，内蒙古自治区生态环境系统以改善环境质量为核心，以打赢污染防治攻坚战标志性战役为主线，以环境执法大练兵为抓手，不断创新环境执法机制，建立健全环境执法制度体系，执法能力明显提高，环境违法行为得到有效遏制，生态环境执法工作实现新突破。
“十三五”以来，自治区持续开展蓝天保卫战重点地区强化督查，检查呼和浩特、包头、乌海及周边地区1.1万个企业（点位），帮助发现和推动解决涉气环境问题3932个，立案处罚209起，三地采暖期空气质量均得到改善。同时，推动拆除4000多平方米影响水源安全的违章建筑，解决63个历史遗留的硬骨头问题，成为全国第五个完成水源地环境问题整改任务的省区。
此外，，内蒙古自治区生态环境系统还连续3年开展“一湖两海”专项执法检查，发现污水处理厂提标改造进度缓慢、污染物超标排放等各类环境违法问题96个。
切实做好环境信访投诉处理工作。全区12个盟市及所有旗县区实现“12369”举报热线电话全覆盖，自治区本级和12个盟市生态环境部门在官方网站加挂全国统一的网络举报平台，实现了全国环保举报数据联网共享。受理群众举报案件29137起，微信举报3794起，网络举报1561起，全部办结。排查、接收涉黑涉恶问题线索194个，移交问题线索157个，接收办理纪检监察、公安、法院、检察院“三书一函”936件，1134个行业乱象问题已全部整改到位，一批群众反映强烈、历史上久拖不决的突出环境问题得到解决。
加强司法协作，内蒙古自治区生态环境厅联合自治区公安厅、自治区人民检察院制定印发《关于转发〈环境保护行政执法与刑事司法衔接工作办法〉的通知》，进一步健全环境保护行政执法与刑事司法衔接工作机制。
自治区以下环保机构监测监察执法垂直管理制度改革全部完成。连续5年开展“全年、全员、全过程”执法大练兵，16个单位获评生态环境部环境执法大练兵先进集体，28名同志获评先进个人。组织、参加各类环境监察执法培训91次，累计培训17030人（次），执法人员持证上岗率100%。
自治区本级、11个盟市和51个旗、县、区，生态环境部门以及6个重点化工园区、1886家重点企业完成了环境应急预案制定、修编和备案工作，黄河流域涉及的7个盟市涉危涉重403家企业完成应急预案电子备案。与宁夏回族自治区、甘肃等7省自治区签订《跨省（区）流域上下游突发水污染事件联防联控机制框架协议》，推动建立跨区域环境应急协调联动机制。
